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1.海洋研究专业
1967年东京大学海洋研究所建在一艘大型海洋勘察船，开展海洋勘察和海洋综合研究，后又建造一艘更加先进的船，同美国财团合作，进行深海钻探，重大海洋地壳构成、海底生态、海底资源开发等领域。文部省拨款组织东京大学等校人员数次参加南极的综合科学考察。
2.宇航研究专业
以东京大学宇宙线研究所为首的此项研究有较大的开展，日本政府每年拨款百余亿日元设备制造费和试验费，至今已发射了14颗卫星和多颗运载火箭，进行极光观测，探测行星和地球磁场，开展天文物理、无人宇宙实验室的试验。
3.癌研究专业
早在1983年日本政府提出“癌研究十年计划，由东京大学、东北、大阪等大学参加，并与美国有关研究机构合作，集中对致癌原因、诊断方法、治疗途径三方面进行研究。研究还涉及生物化学、遗传学、核物理学等学科，东京大学的医学科学研究是该项研究中的中坚力量。
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